mRNA Cap2'-O-metüültransferaas
mRNA Cap 2'-O-metüültransferaas tuletati rekombinantsest E. coli tüvest, mis kannab vaktsiinia mRNA Cap 2'-O-metüültransferaasi geeni.See ensüüm lisab metüülrühma esimese nukleotiidi positsioonis 2'-O, mis külgneb RNA 5'-otsa cap-struktuuriga. Ensüüm kasutab S-adenosüülmetioniini (SAM) metüüldoonorina, et metüülida kaetud RNA (kork) -0), mille tulemuseks on cap-1 struktuur.
Cap1 struktuur võib suurendada translatsiooni efektiivsust, parandades mRNA ekspressiooni transfektsiooni- ja mikroinjektsioonikatsetes. See ensüüm vajab spetsiifiliselt RNA-d, millel on substraadina m7GpppN cap.See ei saa kasutada RNA-d, mille 5' otsas on pN, ppN, pppN või GpppN.Korgiga RNA võib valmistada in vitro transkriptsiooni teel, kasutades cap-analoogi, või ensümaatilise katmise teel, kasutades Vaccinia piiramisensüümi.
Komponendid
mRNA Cap 2´-O-metüültransferaas (50U/μL)
10 × korkimisreaktsiooni puhver
Säilitamine
-25 ~- 15 ℃ ladustamiseks (Vältige korduvaid külmutamise-sulatamise tsükleid)
Salvestuspuhver
20 mM Tris-HCl (pH 8,0, 25 ℃), 100 mM NaCl, 1 mM DTT, 0,1 mM EDTA, 0,1% Triton X-100, 50% glütserooli.
Ühiku määratlus
Üks ühik on defineeritud kui ensüümi kogus, mis on vajalik 10 pmooli 80 nt kaetud RNA transkripti metüülimiseks 1 tunni jooksul temperatuuril 37 °C.
Kvaliteedikontrolli analüüsid
Eksonukleaas:50 U mRNA Cap 2´-O-metüültransferaas koos 1 µg λ-Hind III lõhustatud DNA-ga temperatuuril 37 ℃ 16 tundi ei anna agaroosgeelelektroforeesiga määratud lagunemist.
Endonukleaas: 50 U mRNA Cap 2´-O-metüültransferaasi koos 1 μg λDNA-ga temperatuuril 37 ℃ 16 tundi ei too agaroosgeelelektroforeesiga määratud lagunemist.
Nickase: 50 U mRNA Cap 2´-O-metüültransferaasi koos 1 µg pBR322-ga temperatuuril 37 ℃ 16 tundi ei põhjusta agaroosgeelelektroforeesiga määratud lagunemist.
RNaasi: 50 U mRNA Cap 2´ -O-metüültransferaasi koos 1,6 µg MS2 RNA-ga 4 tundi temperatuuril 37 ℃ ei põhjusta agaroosgeelelektroforeesiga määratud lagunemist.
E. coli DNA: 50 U mRNA Cap 2´-O-metüültransferaasi skriinitakseE. coli genoomne DNA, kasutades TaqMan qPCR-i koos selle jaoks spetsiifiliste praimeritegaE. coli 16S rRNA lookus.TheE. coli genoomne DNA saastumine on =1E. coli genoom.
Bakteriaalne Endotoksiin: LAL-test, vastavalt Hiina farmakopöa IV 2020. aasta väljaandele, geelipiiri katsemeetod, üldreegel (1143).Bakterite endotoksiinide sisaldus peaks olema =10 EU/mg.
Reaktsioonisüsteem ja tingimused
1. Kombineerige sobiv kogus kaetud RNA-d ja RNaasivaba H2O 1,5 ml mikrofuugituubis lõppmahuni 16,0 µL.
2. Kuumutage 5 minutit temperatuuril 65 ℃ ja seejärel 5 minutit jäävanni.
3. Lisage järgmised komponendid määratud järjekorras (Capped RNA metüülimiseks
vähem kui 10
Komponent | Helitugevus |
Denatureeritud kaetud RNA | 16 μL |
10-kordne korkimisreaktsiooni puhver* | 2 μL |
SAM (4 mM) | 1 μL |
mRNA Cap 2´-O-metüültransferaas (50 U/μL) | 1 μL |
ddH2O | Kuni 20 μL |
*10x korkimisreaktsiooni puhver: 500 mM Tris-HCl (pH 8,0, 25 ℃), 50 mM KCl, 10 mM MgCl2 、 10 mM DTT.
4. Inkubeerige 37 ℃ juures 1 tund (vähem kui 200 nt sihtfragmendi puhul on soovitatav inkubeerida 2 tundi).
Rakendused
MRNA ekspressiooni parandamiseks mikrosüstimise ja transfektsiooni katsete ajal.
Märkused kasutamise kohta
1. Enne reaktsiooni RNA tuleb puhastada ja lahustada nukleaasivabas vees, kõik lahused ei tohi sisaldada EDTA-d ega ioone.
2. Soovitatav on RNA proovi kuumutada temperatuuril 65 ℃ 5 minutit enne reaktsiooni, et eemaldada transkripti 5' otsast sekundaarne struktuur.Seda saab pikendada 10 minutini keeruka 5 ´-terminali struktuuri jaoks.